Geomview

Salah satu kemampuan Gaussian03 adalah melakukan perhitungan dalam fasa cairan dengan berbagai pelarut. Sayangnya, untuk bisa melihat bagaimana solvasi pelarut harus menggunakan software lain, GeomView. Jika file .log tadi dibuka menggunakan GaussView, maka tidak akan terlihat adanya solvasi.


Bagi pengguna Debian GeomView ini ternyata sudah ada di repository Debian. cukup dengan menginstall menggunakan “apt-get install geomview atau aptitude install geomview”. Lalu bagaimana untuk membuat input untuk GeomView? Caranya sangat simpel sekali, cukup dengan menambahkan geomview di akhir file input. kita ambil contoh solvasi dari test690.com-nya Gaussian

#p b3lyp/6-31g(d) scrf=(iefpcm,read) test scf=tight

Gaussian Test Job 690 (Part 1):
cyanacetic acid in a ionic solution with Ionic strength= 0.1 M

0 1
6 0.937841 -0.248321 0.000000
8 2.142717 -0.115157 0.000000
8 0.290290 -1.412747 0.000000
6 0.000000 0.960825 0.000000
1 0.967804 -2.149248 0.000000
6 -1.428665 0.655290 0.000000
1 0.241840 1.571515 0.880398
1 0.241840 1.571515 -0.880398
7 -2.567228 0.431811 0.000000

ionic dism=0.1
geomview

kemudian akan muncul file tesserae.off yang bisa dibuka di geomview

Semoga bermanfa’at!
😀

#terus terang saya juga belum pernah memakai geomview untuk keperluan visualisasi😦

#contoh

Leave a Reply

Fill in your details below or click an icon to log in:

WordPress.com Logo

You are commenting using your WordPress.com account. Log Out / Change )

Twitter picture

You are commenting using your Twitter account. Log Out / Change )

Facebook photo

You are commenting using your Facebook account. Log Out / Change )

Google+ photo

You are commenting using your Google+ account. Log Out / Change )

Connecting to %s