install PTRAJ

assalamu’alaikum warahmatullahi wabarakatuh….

 

dalam dua minggu ini saya berkutat dengan AMBER, meski cuma bisa pakai versi yang free tapi tidak apa-apalah itu sudah cukup. instalasi AMBER cukup mudah dan pernah ditulis di sini. namun demikian, ternyata tool untuk analisis, PTRAJ tidak ikut terkompilasi sehingga harus dikompilasi manual.

 

untuk kompilasi PTRAJ, kita tidak dapat menggunakan opsi -mpi sewaktu melakukan configure sehingga harus configure lagi. langkah-langkahnya seperti biasa :

  1. export AMBERHOME=alamat folder AMBER
  2. ./configure gnu
  3. masuk ke folder AmberTools/src/ptraj
  4. make

kira-kira demikian cara instalasi PTRAJ. oke cukup sekian dan semoga¬† bermanfa’at

 

Leave a Reply

Fill in your details below or click an icon to log in:

WordPress.com Logo

You are commenting using your WordPress.com account. Log Out / Change )

Twitter picture

You are commenting using your Twitter account. Log Out / Change )

Facebook photo

You are commenting using your Facebook account. Log Out / Change )

Google+ photo

You are commenting using your Google+ account. Log Out / Change )

Connecting to %s