menggambar kotak simulasi di VMD

assalamu’alaikum warahmatullahi wabarakatuh..

kemarin lihat teman membuat kotak simulasi di VMD. Dia menggunakan file .gro buatan Gromacs. Untuk tipe file yang lain berikut adalah cara untuk menampilkan kotak simulasi di VMD. yang perlu diingat adalah satuan dalam nm (CMIIW), bisa disesuaikan dengan ukuran kotak simulasi milik teman-teman. di command line vmd bisa digunakan perintah berikut :

vmd > set cell [pbc set {22 22 22} -all]

vmd > pbc box -center origin -color black -width 3

box

# http://rchang90.wordpress.com/2011/09/23/how-to-draw-a-simulation-box-in-vmd/

 

One thought on “menggambar kotak simulasi di VMD

  1. Pingback: visualisasi sphere kulit solvasi pertama VMD – END | neax502's simple blog

Leave a Reply

Fill in your details below or click an icon to log in:

WordPress.com Logo

You are commenting using your WordPress.com account. Log Out / Change )

Twitter picture

You are commenting using your Twitter account. Log Out / Change )

Facebook photo

You are commenting using your Facebook account. Log Out / Change )

Google+ photo

You are commenting using your Google+ account. Log Out / Change )

Connecting to %s