pra optimasi bagian 1

Assalamu’alaikum warahmatullahi wabarakatuh…

Optimasi merupakan salah satu hal terpenting dalam penelitian di kimia komputasi. Biasanya proses inilah yang cukup banyak memakan waktu.  Apalagi jika kita akan melakukan penelitian dengan metode yang cukup memakan waktu lama seperti menggunakan basis set yang besar plus fungsi difusi dan polarisasi atau menggunakan metode yang memakai korelasi antar elektron. Namun demikian, ada beberapa cara sederhana untuk mempercepat proses optimasi antara lain dengan menggunakan pre optimization method yaitu, mengoptimasi dengan level teori yang lebih rendah kemudian dioptimasi kembali dengan metode yang kita inginkan. Permasalahannya adalah metode apa yang harus digunakan terlebih dahulu?

Software kimia komputasi tidak memiliki cara otomatis untuk memilih metode mana yang harus digunakan, setahuku hanya software ORCA yang memiliki cara semi otomatis dengan menggunakan HF-3C, di mana optimasi akan dilakukan dengan metode HF dengan basis set kecil/minimal yang sudah dimodifikasi dengan menambahkan koreksi dispersi. Metode ini bisa digunakan untuk senyawa organik, supramolekular dan protein.

Misalnya kita ingin mengoptimasi struktur dengan metode DFT maka, cara standar yang bisa dilakukan untuk pre optimasi adalah

1. optimasi terlebih dahulu menggunakan HF, AM1 dan PM3
2. mengubah fungsi basis ke yang lebih kecil seperti 3-21G* atau STO-3G
3. menambahkan scf=(conver=4)
4. menambahkan opt=loose
5. dan beberapa cara lain

Intinya adalah bagaimana kita bisa menggunakan struktur yang lebih baik dan mendekati struktur final serta bisa membaca initial guess dari perhitungan sebelumnya. Cara no 3 dan 4 adalah keyword Gaussian, untuk GAMESS kita bisa menaikkan kriteria konvergensi (lihat gambar), begitu juga jika kita menggunakan HyperChem. Untuk NWChem, optimasi menggunakan modul Driver, maka kita bisa menambahkan

Driver
loose
end
scf

Beberapa program kimia komputasi pun juga memberikan keleluasaan pada user untuk mengatur secara manual bagaimana settingan DFT yang akan digunakan, seperti kriteria grid yang akan digunakan, konvergensi seperti fine, ultrafine atau mengatur secara manual.

(bersambung)

# Insya Allah postingan ini akan dilanjutkan, saat ini komputer rumah lagi sibuk digunakan adikku untuk belajar menjelang UAS

# Bagi pengguna Gaussian, bisa membaca tulisan cara menggunakan file .chk

 

Leave a Reply

Fill in your details below or click an icon to log in:

WordPress.com Logo

You are commenting using your WordPress.com account. Log Out / Change )

Twitter picture

You are commenting using your Twitter account. Log Out / Change )

Facebook photo

You are commenting using your Facebook account. Log Out / Change )

Google+ photo

You are commenting using your Google+ account. Log Out / Change )

Connecting to %s