build fmo input using facio

Saat ini kita telah memasuki bahasan terakhir tentang bagaimana membuat input FMO. Di kesempatan ini kita akan membahas membuat input FMO menggunakan Facio. Hmm, tentang Facio sudah pernah kubahas sedikit sebelumnya. Pada dasarnya membuat input FMO menggunakan facio hampir sama dengan menggunakan fmoutil tetapi karena ada GUI jadi hanya dibutuhkan beberapa klik saja.

Pada dasarnya untuk membuat input FMO menggunakan Facio adalah sebagai berikut :
2
Fragmentasi untuk peptida, nukleotida dan sakarida akan dilakukan secara otomatis tetapi untuk selain itu kita harus mendefinisikan sendiri fragmentasi yang diinginkan. Salah satu kesulitan yang kutemui adalah bagaimana caranya membuat multilayer FMO. Berikut adalah screenshotnya :
1
Oke, cukup sekian saja tentang membuat input FMO dan semoga bermanfa’at!

Leave a Reply

Fill in your details below or click an icon to log in:

WordPress.com Logo

You are commenting using your WordPress.com account. Log Out / Change )

Twitter picture

You are commenting using your Twitter account. Log Out / Change )

Facebook photo

You are commenting using your Facebook account. Log Out / Change )

Google+ photo

You are commenting using your Google+ account. Log Out / Change )

Connecting to %s