Counterpoise with different charges and multiplicites gaussian 03

Assalamu’alaikum warahmatullahi wabarakatuh..

Dalam beberapa tulisan terdahulu kita telah membahas BSSE dengan metode counterpoise baik di NWChem dan Gaussian. Jika di NWChem kita dengan mudah memasukkan input untuk metode counterpoise dengan fragmen yang memiliki muatan yang berbeda, lalu bagaimana dengan Gaussian? Mengingat metode yang pernah dibahas di tulisan terdahulu hanya menampilkan total charge dan total spin multiplicity.

Sebenarnya tulisan ini masih terinspirasi dari penelitian interaksi antara logam dengan DNP yang telah lalu, hehe tiba-tiba saja ingin membahasnya saja. Oke, kita perlu membuat input dalam bentuk koordinat z-matrix agar bisa memasukkan nilai charge dan muatan untuk masing-masing fragmen. Hal ini akan mudah dibuat menggunakan Avogadro atau Gabedit. Misalnya pada contoh berikut ini :

#p uhf/3-21g counter=2 test scf=tight opt freq

Gaussian Test Job 562:
Counterpoise with different charges and multiplicites

0,1,0,3,1,2
O,0.0,0.0,0.0,1
O,1,ROO,2
X,1,1.,2,X3O
H,1,RO1H,3,HOX3,2,90.,0,1
H,1,RO1H,3,HOX3,2,-90.,0,1
X,2,1.,1,52.5,3,180.,0
H,2,RO2H1,6,H7OX,1,180.,0,2
H,2,RO2H2,6,H8OX,1,0.,0,2

ROO=2.98308
RO1H=0.94839
X3O=120.2827
HOX3=52.90868
RO2H1=0.94686
RO2H2=0.95173
H7OX=52.98178
H8OX=51.9632

note :
syntax untuk charge dan spin multiplicity -> total-charge, total-spin, frag. 1-charge, frag.1 multiplicity, frag. 2 charge, frag. 2 multiplicity

atom pertama ditulis dalam koordinat kartesian (0.0,0.0,0.0)
angka 1 dan 2 di bagian akhir koordinat merujuk pada fragmen 1 dan 2
input z-matrix memerlukan akhiran 0 setelah harga sudut dihedral/variabel dihedral (untuk memastikan sudut final adalah dihedral) sebelum fragmen 1 dan 2.

Kalian bisa membuat input dengan mudah dengan bantuan input deck Avogadro atau Gabedit (buka dulu dengan Gabedit, lalu disimpan dalam gaussian z-matrix file dan dibuka kembali dengan Gabedit untuk membuat input bsse).

Oke, simpel bukan, semoga bermanfa’at!

# Gaussian manual
# test562.com

One thought on “Counterpoise with different charges and multiplicites gaussian 03

  1. Pingback: bsse in GAMESS « neax502 simple blog

Leave a Reply

Fill in your details below or click an icon to log in:

WordPress.com Logo

You are commenting using your WordPress.com account. Log Out / Change )

Twitter picture

You are commenting using your Twitter account. Log Out / Change )

Facebook photo

You are commenting using your Facebook account. Log Out / Change )

Google+ photo

You are commenting using your Google+ account. Log Out / Change )

Connecting to %s