xmgrace tutorial : grafik dengan skala yang berbeda

assalamu’alaikum warahmatullahi wabarakatuh..

long time no updates, hari ini kita akan membuat grafik dengan skala yang berbeda di sumbu y menggunakan xmgrace. grafik ini bisa teman-teman jumpai misalnya pada penelitian tentang simulasi ion dalam larutan, terutama untuk analisis rdf (radial distribution function).
Continue reading

adding external basis set to turbomole

Assalamu’alaikum warahmatullahi wabarakatuh

kali ini kita akan mencoba memasukkan basis set eksternal ke dalam turbomole. di beberapa tulisan yang telah lalu kita telah mencoba memasukkan basis set eksternal ke dalam gaussian dan gamess tetapi karena penelitianku menggunakan turbomole jadi mau tidak mau harus bisa.
Continue reading

travis analyzer tool to analyze and visualize molecular dynamics and monte carlo simulation

assalamu’alaikum warahmatullahi wabarakatuh..

 

teman-teman sudah ada yang pernah mencoba travis ? tool ini digunakan untuk analisis trajektori dinamika molekular dan monte carlo. meski fiturnya melimpah tapi sangat sulit dipakai. di webnya sendiri juga tidak tersedia user manual. jujur saja, sampai hari ini saya belum berhasil menggunakan travis

install abinit using intel fortran and C compiler

Assalamu’alaikum warahmatullahi wabarakatuh..

Kali ini kita akanĀ  membahas tentang bagaimana kompilasi abinit menggunakan intel fortran dan intel c compiler. Abinit adalah salah satu program yang bersifat free untuk perhitungan menggunakan plane wave.
Continue reading

metode hartree-fock, simple explanation

Assalamu’alaikum teman-teman :)

Kembali lagi nih hehe. Kali ini kita akan mencoba bicara tentang ab initio. Bagi yang pernah kuliah kimia komputasi pasti akrab dengan dua kata ini kan. Sebenarnya banyak sekali web atau artikel yang membahas tentang ab initio dan pembahasan mendalam butuh pemahaman yang mendalam juga tentang mekanika kuantum (saya bukan ahli mekanika kuantum lho, maklumlah selama kuliah mata kuliah yang ada matematikanya bisa dihitung dengan jari). Namun, di sini kita mencoba membahas secara umum saja tentang ab initio itu. Bismillaah.
Continue reading