running ECCE in OpenSuse

assalamu’alaikum warahmatullahi wabarakatuh…

since I moved to opensuse, ECCE cannot run again because ECCE cannot recognize the hostname. beside that I never use ECCE again, but if you want to run ECCE please note that you should change the hostname first (Using YAST, its very easy!) and then install ECCE as usual :).

ecce1

ecce
now it works!

radial distribution function (RDF)

assalamu’alaikum warahmatullahi wabarakatuh

ketemu lagi ya :), kali ini aku ingin membahas sedikit tentang analisis trajektori yang biasa dilakukan dalam simulasi dinamika molekular, terutama untuk ion-pelarut. namun, mungkin bisa juga digunakan untuk sistem yang lain.

Continue reading

antara aku, kau dan dia part 45 memories in gundam’s film

assalamu’alaikum warahmatullahi wabarakatuh…

Gundam, tentu sebagian orang mengenal serial film robot dari jepang ini, termasuk saya. bisa dibilang saya juga penggemar film gundam tetapi cuma fanatik terhadap Gundam seed dan Gundam seed destiny saja. mengapa ? sederhana saja, kedua serial tersebut yang paling berkesan.
Continue reading

vmd tutorial : selection CPK and Licorice

assalamu’alaikum warahmatullahi wabarakatuh…

Simulasi sudah hampir selesai, waktunya iseng-iseng membuat gambar seperti yang ada di paper dengan VMD. Setelah pusing tidak nemu caranya akhirnya langkah terakhir adalah mengontak Lorenz. Inilah jawabannya untuk membuat seleksi yang berbeda menggunakan VMD (menggunakan model CPK dan Licorice).
Continue reading